李迪

简介


特聘研究员,博士生导师。2010年本科毕业于山东大学。2016年于中国科学技术大学获博士学位。2016年至2024年在中国科学院生物物理研究所任正高级工程师。202410月加入中国科学院物理研究所任特聘研究员、博士生导师。曾获得国家“高层次人才青年项目”、北京市“科技新星”和朝阳“凤凰计划人才”等。现任北京市朝阳区青年联合会委员和中国科学院“青促会”生命分会委员

主要研究方向


 

光学物理学、自动化科学、人工智能和生命科学交叉科学研究:

(1) 超分辨率荧光显微成像技术

(2) 牵引力超分辨显微镜技术

(3) 经典算法和人工智能相融合的图像处理分析

(4) 细胞生物学(细胞微观力学、细胞器互作、未折叠蛋白响应等)

过去的主要工作及获得的成果


 

光学显微镜可以无损观测生物或其他样本的动态活动,还可结合荧光技术“点亮”任意特定结构。但是光的波动性质限制了光学显微镜的空间分辨率,这一分辨率极限称之为衍射极限,常用的绿色荧光分辨率约250nm。而突破光学衍射极限的超分辨率荧光成像技术能以更高的空间分辨率观测更加细微的生物样本。

超分辨成像技术中,结构光照明超分辨成像技术(SIM)具有成像速度快、光毒性小的优势,是最适合活体样本动态研究的超分辨技术,但传统SIM技术受空间分辨率、照明深度、背景噪声和成像时长等因素限制无法满足亚细胞超微动态观测的需求。

针对成像技术开发瓶颈,我们近五年致力于从事超分辨率荧光显微镜开发研究,通过提出软、硬件新方案实现提升了10倍以上的成像深度、速度和时程,并拓展了微观力学探测维度等五维多模态成像,发现了多种细胞器互作新行为和力学新现象,相关成果推动了微观生物学领域的发展。其中掠入射结构光照明超分辨成像技术(GI-SIM, Cell, 2018)获得2018年度中国科学十大进展。相关技术已授权发明专利10项,其中4项已技术转让425万元

代表性论文及专利


 

代表性论文(#表示第一作者/共同第一作者;*表示通讯作者):

[1] Chuyu Fang#, Xinwen Pan#, Di Li#, Wei Chen, Ying Huang, Yawen Chen, Luan Li, Qi Gao, Xin Liang, Dong Li*, Xueliang Zhu*, and Xiumin Yan*, Distinct Roles of Kif6 and Kif9 in Mammalian Ciliary Trafficking and Motility[J]. Journal of Cell Biology, 2024, 223 (11): e202312060

[2] Chang Qiao#, Di Li#, Yong Liu#, Siwei Zhang#, Kan Liu, Chong Liu, Yuting Guo, Tao Jiang, Chuyu Fang, Nan Li, Yunmin Zeng, Kangmin He, Xueliang Zhu, Jennifer Lippincott-Schwartz*, Qionghai Dai*,  Dong Li*, Rationalized deep learning super-resolution microscopy for sustained live imaging of rapid subcellular processes [J]. Nature Biotechnology, 2023, 41, 367-377.

[3] Di Li#, Huw Colin-York#, Liliana Barbieri#, Yousef Javanmardi#, Yuting Guo, Kseniya Korobchevskaya, Emad Moeendarbary*, Dong Li*, Marco Fritzsche*, Astigmatic Traction Force Microscopy (aTFM) [J]. Nature Communications, 2021, 12(1): 1-10.

[4] Chang Qiao #, Di Li #, Yuting Guo#, Chong Liu#, Tao Jiang, Qionghai Dai*, Dong Li*, Evaluation and development of deep neural networks for image super-resolution in optical microscopy [J]. Nature Methods, 2021, 18(2): 194-202.

[5] Yuting Guo#, Di Li#, Siwei Zhang, Yanrui Yang, Jia-Jia Liu, Xinyu Wang, Chong Liu, Daniel E. Milkie, Regan P. Moore, U. Serdar Tulu, Daniel P. Kiehart, Junjie Hu, Jennifer Lippincott-Schwartz*, Eric Betzig*, Dong Li*, Visualizing intracellular organelle and cytoskeletal interactions at nanoscale resolution on millisecond timescales [J]. Cell, 2018, 175(5): 1430-1442. e1417. 2018 年度中国科学十大进展

[6]  Ma Ying#, Li Di#, Smith Zachary J., Li Dong*, Chu Kaiqin*. Structured illumination microscopy with interleaved reconstruction (SIMILR) [J]. Journal of Biophotonics, 2018, 11(2): e201700090.

[7]  Di Li#, Jin-Hua Zhou, Xin-Yao Hu, Min-Cheng Zhong, Lei Gong, Zi-Qiang Wang, Hao-Wei Wang, Yin-Mei Li, In situ calibrating optical tweezers with sinusoidal-wave drag force method [J]. Chinese Physics B, 2015, 24(11): 118703.

[8]  Yuan Yue#, Li Di#, Zhang Jia, Chen Xianmin, Zhang Chi, Ding Zhanling, et al. Bridging cells of three colors with two bio-orthogonal click reactions [J]. Chemical Science, 2015, 6(11): 6425-6431.

  

已授权发明专利:

(1) 李迪,李银妹,周金华,呼新尧。一种永久性液态微球样品池。专利号 201410539240.9

(2)李迪,李银妹,呼新尧,周金华。实时温控微型样品室。专利号 201410539238.1

(3)李迪,钱晋,李银妹,呼新尧。一种显微镜内样品温控加热装置和显微镜。专利号 201621289391.4

(4)周金华,李迪,李银妹,钟敏成,王自强。一种基于光学俘获的颗粒粒径检测方法。专利号201410685965.9

(5)周金华,李迪,李银妹,钟敏成,王自强。一种基于光学俘获的原位校准压电平台位移的方法。专利号201410685964.4

(6)周金华,李迪,李银妹,钟敏成,王自强。基于显微成像的图像灰度测量颗粒粒径的方法。专利号201410685961.0

(7)李栋,李迪。一种激发光偏振高速调控装置。专利号 201910189594.8

(8)李栋,李迪,张思微,刘勇。高速多色多模态结构光照明超分辨显微成像系统及其方法。专利号201710495353.7

(9)李栋,张思微,李迪。一种荧光显微成像的系统。专利号202010978511.6

(10)李栋,乔畅,李迪。图像超分辨率处理方法。专利号202011637663.6

培养研究生情况


 

1. 每年招收研究生(学术/工程硕士、硕博连读生或博士生或)1-3。欢迎有科研热情和团队精神的的同学,学术背景不限。课题组提供世界一流的科研资源和合作交流机会。同时欢迎优秀本科生前来开展毕业设计研究,课题组提供科研补助。

此外,欢迎科研助理和联合培养研究生加入(长期有效),课题组提供有竞争力的科研补助 

2. 长期高薪聘请博士后,学历及专业背景要求如下:

1)光学或光学工程等相关背景;熟悉光学、有完整搭建光学系统经验者优先。

2)图像算法、自动化控制、人工智能等相关背景;具备LabviewMatlabPython等计算机编程或人工智能图像算法经验者优先。

3)细胞生物学或发育生物学背景:有荧光成像经验者优先。

博士后待遇请参照(或面议):

http://www.iop.cas.cn/zszp/zp/202104/t20210427_5999597.html

其他联系方式


 

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电话:010-82648130

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